Post on 26-Jan-2021
transcript
Serveis Cientificotècnics (SCT)26 de gener de 2009
2
ANYS 07/08 (PRBB)
• Laboratoris Comuns– Histologia, Microscòpia, Cultius “externs”, Cultius P2, Reveladora, Instal·lació Radioactiva
• Aparells d’utilització comuna– Ubicats en diferents laboratoris: identificador carbassa
• Centralització d’alguns serveis: – Esterilització, Criopreservació
• Posta en marxa de nous serveis:– Instal·lació i training plataforma de Microarrays
3
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
4
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
5
INSTAL·LACIÓ RADIOACTIVA
• Instal·lacions: cambra calenta (“hot lab”), 4 poiates radioactives en 4 laboratoris
• Accés restringit
• Formació a l’usuari
• Aplicatiu: comandes “on line”, registre i consum d’isòtops, usuaris, responsables, etc.
6
APLICATIU I.R.
7
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
MTorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
8
ESTERILITZACIÓ
9
• Àrea de neteja:– Rentat i descontaminació del material volumètric (diari)– Neteja de laboratoris i equipaments
• Calendari programat: Col·laboració dels investigadors !!!– Emergències de neteja.
• Àrea d’esterilització:– Autoclavat de material volumètric (diari)– Servei d’autoclavat de solucions i tampons (diari)– Autoclavat de residus biològics
ESTERILITZACIÓ
Responsable: Montserrat Hidalgo
10
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
11
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
12
Direcció SCTMontserrat Torà
SecretariaJordi Manaut
QualitatXavier Palazón
Serveis d’Assessorament
PublicacióBiomèdicaMarta Pulido
AMIB (Metodologia i Bioestadística)
Sergi Mojal
Microarrays Lara Nonell
E.Puigdecanet
Criopreservació i Biobancs
Núria Somoza
EsterilitzacióMontserrat Hidalgo
Cultius i P2Xavier Mayol
Piedad Navarro
Laboratoris Comuns
Piedad Navarro
Histologia
Microscòpia
Cambra fosca i reveladora
Aparellscomuns
Instal·lacióRadioactiva
Mtorà/IHernàndez
InfraestructuresH. del Mar
Servei Patologia
Preparació Blocs d’Histologia
Mª Lluïsa MariñosoConxa Naya
SKY (Cariotipatespectral)
Francesc Solé
MicrodissectorLasser
B. Bellosillo
Microscòpia ElectrònicaJosep Lloreta
ORGANITZACIÓ FUNCIONAL DELS SCT
13
ANY 2009
• Unificació i ampliació de Cultius
• Nova instal·lació de Criopreservació (biobancs) soterrani PRBB
• Posta en marxa del Servei de Microarrays (SAM)
• Programa de Gestió de la Qualitat del SCT
• Sessions SCT: Microarrays, Criopreservació, Cultius, Edició Mèdica,…
14
COMUNICACIÓ
• Rebre el feed back dels investigadors: iniciatives, propostes, necessitats,…
• Canalització de les propostes (des dels investigadors als SCT): a través dels Caps de Programa
• Informació als investigadors (des dels SCT als investigadors):
– General: a través dels Caps de Programa que n’han de fer difusió a les persones del seu grup Caps de grup investigadors i tècnics
– Específica: a través de llistats d’usuaris registrats a la I.R., Cultius, P2, etc.
15
SCT
CRIOPRESERVACIÓNúria Somoza
17
QUINS SERVEIS OFERIM?
CRIOPRESERVACIÓ
Monitoritzacióequips fred
Assignacióespais fred/
Gestió localitzaciómostres
Centralització /Repartiment gel sec
Assessorament
Transport mostres
Codificació/etiquetatmostres
BiobancsDispensació N2Len lleteres
18
MONITORITZACIÓ EQUIPS FRED
• Tots els equips estan monitoritzats mitjançant sondes externes i emissors RF (radiofreqüència).
• Les dades s’envien a un servidor on són emmagatzemades.
• Els grups interessats en tenir els registres ho poden sol·licitar per correu electrònic indicant l’equip de fred i la periodicitat en que ho volen rebre.
19
GRÀFIC DEL REGISTRES DE Tª D’UN CONGELADOR -80ºC
20
GESTIÓ DELS ESPAIS DE FRED
• Instal·lacions:– Cambra 4ºC, Cambres -20ºC, sales amb control d’accés per ultracongeladors, 2 contenidors
automàtics N2L.
• Gestió de l’espai :– Assignació espai– Ampliació espai– Nou equip fred
• Com gestionem l’espai?:– Comunicació de necessitats mitjançant el qüestionari de projectes de criopreservació– Aplicatiu criopreservació per assignar l’espai als diferents projectes
21
QÜESTIONARI PROJECTES CRIOPRESERVACIÓ
22
Gestió de l’espai
23
APLICATIU: GESTIÓ ESPAIS
24
Gestió localització mostres
25
APLICATIU: GESTIÓ LOCALITZACIÓ MOSTRES
26
Gel sec
• Centralització del gel sec que es rep en enviaments de reactius/mostres
• Repartiment als grups que ho demanin, sol·licitar-ho amb temps suficient
• Emplenat de lleteres amb N2L: sol·licitud mitjançant correu electrònic
• Obertura tancs per recollida/entrega de mostres: dimarts i dijous a les 12h
N2L
Altres serveis
27
ASSESSORAMENT
• Formació en prevenció de riscos associats a la manipulació N2L
• Transport de mostres biològiques
• Codificació i etiquetat
28
PERSPECTIVES 2009
• Noves instal·lacions: – Adequació d'àrea planta -2 dedicada a ultracongeladors per mostres biobancs.– Accés restringit
• Desplegament aplicatiu per gestionar localització mostres
*BOE número 159 de 4/7/2007 LEY 14/2007, de 3 de julio, de Investigación biomédica
29
QUI SOM I COM CONTACTAR?
• Núria Somoza:
Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (despatx 121, costat hospital)Doctor Aiguader, 88 | 08003 BarcelonaTel. 933 160699nsomoza@imim.eswww.imim.es
SERVEI D’ANÀLISI DE MICROARRAYS (SAM)Lara Nonell
31
QUÈ ÉS I QUÈ FEM?
• Nou servei cientificotècnic de suport per a estudis d’investigacióbàsica, farmacogenòmica i, fins i tot, de diagnòstic
• Processat de microarrays utilitzant la plataforma tecnològica GeneChip d’Affymetrix
• Servei integrat per a estudis d’expressió gènica i de genòmica– Orientació en el disseny – Processat dels microarrays– Anàlisi de dades
• Servei prioritari a l’IMIM i PRBB però obert a altres institucions
32
Arrays humans disponibles• Human Exon 1.0 ST• GW Human SNP array 6.0
Possibilitat d’utilitzar microarrays d’altres tipus i espècies
APLICACIONS
• Arrays d’expressió– Descobriment de nous gens/biomarcadors involucrats en mecanismes complexos– Estudis de perfils d’expressió gènica, farmacogenòmica i toxicogenòmica– Classificació i models predictius de malalties complexes– Detecció de splicing alternatiu
• Arrays de SNPs– Detecció de guanys i pèrdues de regions genòmiques (cariotip molecular, LOH i UPD) – Determinació del nombre de còpies per a la detecció i diagnòstic de malalties genètiques – Genotipat de SNPs– Estudis de genètica poblacional i d’associació
• Aplicacions integrades
33
FUNCIONAMENT
Processat Laboratori
Assessorament
Sol·licitud entrevista
PressupostAprovaciópressupost
SI
NO
Anàlisi de dades
Resultats
34
QUI SOM I ON SOM?
• Responsable del serveiDra. Montse ToràEmail: mtora@imim.es
• Responsable científicDr. Francesc SoléEmail: fsole@imas.imim.es
• Responsable de l’anàlisi de dadesLara NonellEmail: lnonell@imim.es
• Responsable de laboratoriEulàlia PuigdecanetEmail: epuigdecanet@imim.es
• Despatx 166 (ext. 1577)• Laboratori 273.10.01
• Horari d’atencióDll.-DV.: 10-14hDj.: 15-18h
ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARSXavier Mayol
36
ÀREA DE CULTIUS CEL·LULARS
280.01
280.02278P2
276274
en const
rucció
Cabines de bioseguretat 4 5 (2) 2 4 = 10 + 5
Incubadors CO2 4 6 (2) 2 4 = 10 + 6
Capacitat màxima 16-20 24-30 (?) 8-12 16-20 = 46 + 27(USUARIS)
37
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
38
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
39
• Comandes setmanals / quinzenals
• Medis freqüents D-MEM suplementats FBSRPMI Glutamina
PiruvatEstreptomicina + penicil·lina
• Lot homogeni de FBS ( 2 – 3 anys)
PREPARACIÓ DE MEDIS DE CULTIUS
40
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
41
• Mycoplasma Detection PCR Kit ( Minerva – LabClinics ).
• 1 test / setmana.
TEST DE MICOPLASMA
42
• Preparació de medis de cultius.
• Test de micoplasma.
• Banc de línies cel·lulars.
SERVEIS
43
BANC DE LÍNIES CEL·LULARS
• Projecte dins la xarxa del FIS RTICCC ( 2004 ).
• 150 línies cel·lulars congelades en N2 líquid.
• Qualitat:– Passatges primerencs.– Origen i manteniment.– Micoplasma.
• Entrega de vials congelats 2 dies / setmana.
• 140 usuaris enregistrats.
44
WEB BANC DE LÍNES CEL·LULARS
• http://blc.imim.es
45
QUI SOM i ON SOM?
• Responsable: Xavier Mayol (Programa de Recerca de Càncer)
• Tècnic del servei: Piedad Navarro (SCT)
SERVEI D’ASSESSORAMENT BIOESTADÍSTIC (AMIB)Sergi Mojal
47
SERVEIS QUE S’OFEREIXEN
• Assessorament en el disseny de protocols
• Estimació de la grandària de la mostra
• Generació de llistes d'aleatorització
• Disseny, maneig i control de qualitat de bases de dades
• Anàlisis estadístiques amb programari SPSS, R o d’altres segons convingui
• Generació de gràfiques
• Assessorament en comunicacions i publicacions
48
EXEMPLE DE GRÀFIC
49
DADES DE CONTACTE
• Responsable Sergi Mojal
• Localització: despatx 160
• Tel. +34 93 316 06 34, extensió 1634
• Correu electrònic: smojal@imim.es
SERVEI D’ASSESSORAMENT EN PUBLICACIONS BIOMÈDIQUESMarta Pulido
51
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Valoració de les possibilitats de publicació d'un manuscrit a la literatura internacional i nacional
• Traducció inversa i directa de texts biomèdics especialitzats en: espanyol, català i anglès
• Cerques bibliogràfiques
• Correcció editorial del text (editing)
• Assessorament i cerca de la revista adient
52
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Preparació de la versió final del manuscrit d'acord amb les normes de la revista
• Model de carta al director de la revista per tal de presentar el manuscrit
• Acompliment de formularis: conflictes d'interès, copyright, autoria, separates, etc.
• Valoració de les crítiques del peer review i cartes de resposta als revisors
• Recursos d'Internet i publicació d'articles biomèdics
53
SERVEI INTEGRAL DE LA PUBLICACIÓN BIOMÉDICA QUE INCLOU TOTES LES ETAPES DEL PROCÉS DE PUBLICACIÓ
• Comprovació de referències bibliogràfiques amb la font original
• Disseny de taules i figures
• Tramesa del manuscrit per Internet (sistemes tipus Manuscript Central)
• Llistes de comprovació segons el disseny de l’estudi (CONSORT, STROBE, etc.)
54
FUNCIONAMENT
• Divendres, de 8,30 a 17,00 hores
• Resta de dies contactar per correu electrònic o telefònicament al 93 2007189 y 607732221
55
• Dra. Marta Pulido
• IMIM, despatx 160
• Telèfon 93 3160604
• Correu electrònic:
• mpulido@imim.es y mpulidomestre@gmail.com
RESPONSABLE DEL SERVEI
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT ALS SCTXavier Palazón
57
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT
Quin sistema?Norma ISO 9001:2008
• Què és això?És un sistema que gestiona informació.La informació està continguda en registres (suport paper o electrònic)Els registres estan definits en uns documents que anomenem PNT
• Per a què serveix aquesta informació?Per saber si es treballa en les millors condicionsPer corregir i prevenir problemes Per millorar l’organitzacióPer millorar la prestació de serveis
58
• Què demana que facin els usuaris dels SCT- Col·laboració en el seguiment de la normativa establerta- Participació en els Grups de Millora que es crearan- Adaptació al canvi
EL SISTEMA DE GESTIÓ DE LA QUALITAT DELS SCT
59
QUÈ ÉS EL CICLE DE MILLORA CONTINUA?
Revisióde la direcció
Prestacióde servei
Medició, Anàlisii Millora
Planificació i Gestiódels recursos
USUARISCLIENTS
RequisitsNecessitats
USUARISCLIENTS
SatisfaccióNecessitats
TORN OBERT DE PREGUNTES