Date post: | 01-Jan-2016 |
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Automatización en Microbiología
DR CESAR CABRERA CARRILLO
MEDICO ASISTENTE DEL SERVICIO MICROBIOLOGIA
DEPARTAMENTO PATOLOGIA CLINICA-HNERM
Automatización
en identificación
y pruebas de
sensibilidad
Ventajas de los sistemas automatizados de
estudios de susceptibilidad bacteriana
Desventajas de los sistemas automatizados de
estudios de susceptibilidad bacteriana
Ssitemas automatizados para identificación y
estudio de susceptibilidad bacteriana
• MicroScan Walkaway (Dade)
• Sistema Vitek (BioMerieux)
• Sistema Phoenix (Becton Dickinson)
Sistema Semiautomatizados y Automatizados
en el Peru
MicroScan 1. Equipos
2. Paneles
3. Software de trabajo
4. Sistema experto
MicroScan 1. Equipos
Equipos de Microscan
MicroScan WalkAway 96 plus
MicroScan WalkAway 40 plus
Microscan AutoScan - 4
•Sistema de Lectura
automatizada de paneles
convencionales en solo 5
segundos simplificando
las prueba ID/AST y la
estandarización de
resultados
Microscan AutoScan – 4
Semiautomatizado
Incubar
MicroScan WalkAway 96 plus
Completamente automatizado
MicroScan 2. Paneles
1. Paneles Convencionales
2. Paneles Rápidos
3. Paneles Plus ESBL
4. Paneles Plus Sinergias
• VRE , MRSA
5. Paneles Plus MicroStrep
• MIC para Streptococcus
6. Paneles ID Especiales
• ID de levaduras, BGN
fastidosos, anaerobios
Paneles de MicroScan
MicroScan – Paneles Convencionales
MicroScan – Pos Combo Panel Type 33 (PC 33) (Gram positivos)
- CV (Crystal Violet)-
- MS (Micrococcus Screen)
- NIT (Nitrate)
GLYCOSIDASES
- PGR (PNP Glucoronoside)
- PGT (PNP Galactopyranoside)
- NOV (Novobiocin)
- IDX (Indoxyl Phosphatase)
- VP (Voges-Proskauer)
- OPT (Optochin)
- PHO (Phosphatase)
- BE (Bilis Esculin 40%)
- PYR (Pyrrolidomyl naphthylamide)
- ARG (Arginine)
- URE (Urea)
- MAN (Mannitol)
CARBOHIDRATOS
- LAC (Lactose)
- TRE (Trehalose)
- MNS (Mannose)
- SOR (Sorbitol)
- ARA (Arabinose)
- RBS (Ribose)
- INU (Inulin)
- RAF (Raffinose)
- NACL (Solucion Chloride 6.5%)
- BAC (Bacitracin)
- PRV (Pyruvate)
Microscan - PC 33 (Gram positivos)
MicroScan – PC 33 Antibioticos y diluciones
MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 (NC 50) (Bacilos gram negativos)
CARBOHIDRATOS
- GLU (Glucose)
- SUC (Sucrose)
- SOR (Sorbitol)
- RAF (Raffinose)
- RHA (Rhamnose)
- ARA (Arabinose)
- INO (Inositol)
- ADO (Adonitol)
- MEL (Melbiose)
- URE (Urea)
- H2S (Hydrogen Sulfide)
- IDN (Indole)
- LYS (Lysine)
- ARG (Arginine)
- ORN (Ornithine)
-TDA (Trytophan Deaminase)
- ESC (Esculin Hydrolisis)
- VP (Voges – Proskauer)
- CIT (Citrate)-
- MAL (Malonate)
- ACE (Acetamide)
- TAR (Tartrate)
- ONPG (O NitroPhenyl Galactopyranoside)
- CET (Cetrimide)
- OF/G (Oxidation-Fermentation/Glucosa)
- OF/B (Oxidation-Fermentation/Base)
- DCB (Decarboxylation Control Base)
NC 50 – Bacilos gram negativos
MicroScan – Neg Combo Panel Type 50 Antibioticos y diluciones
MicroScan – Neg Urine Combo Panel Type 55 (NUC 55) (Uropatogenos)
MicroScan – NUC 55 Antibioticos y diluciones
MicroScan 3. Software : LABPRO
4. Sistema Experto : ALERTEX
LABPRO con ALERTEX
1 2 4 8 MIC
8
4
2
1
8
Phoenix 1. Equipos
2. Paneles
3. Software de trabajo
4. Sistema Experto
Phoenix 1. Equipos
• Sistema automatizado de identificación y sensibilidad para bacterias de importancia clínica
• Comunicación intuitiva con el aparato a través de iconos
• Capacidad de incubación de 100 paneles
• Nuevo sistema de inoculación
• Control y calibración interna
Equipo PHOENIX
Phoenix 2. Paneles
• Paneles para ID/AST Combo
o solo AST para :
• Gram negativos
• Gram positivos
• Streptococcus
• Panel de formato único
• Almacenamiento a
temperatura ambiente
• Hermetíco
• Resultados rapidos
• 80% de los resultados de
AST completado en < de
10h.
• Lectura continua cada 20
minutos
PHOENIX - Paneles
• Identificación :
• 45 substratos
•convencionales, fluorogénicos y cromogénicos, carbohidratos, fuentes de carbono, esculina
• Sin adición de reactivos
• Sin tests complementarios • 5 base de datos • Resultados a las 2, 3, 4, 6 y 12
horas
• Información de valores de
confianza, y reacciones de los
substratos
• B-Lact en la parte ID para los
paneles G+
PHOENIX - Paneles
• Sensibilidad : • 20 a 22 antibioticos por
panel • > de 3 dil por Ab • Doble diluciones
• ESBL incluido en cada
panel G- con 2 metodos
de detección
PHOENIX - Paneles
Phoenix
3. Software: EPICENTER
4. Sistema Experto: BDXpert
Vitek 2 1. Equipos
2. Tarjetas
3. Software de trabajo
4. Sistema Experto
Vitek 2 1. Equipos
Equipo Vitek 2 Compact
Vitek 2 compact 40
Vitek 2 compact 60
Vitek 2 2. Tarjetas
Vitek 2 - Tarjetas
Vitek 2 3. Software
4. Sistema Experto
As presented at the 105th General Meeting of the
American Society for Microbiology, 2005.
As presented at the 105th General Meeting of the
American Society for Microbiology, 2005.
Automatización
en hemocultivos
AUTOMATIZACION EN
HEMOCULTIVOS
•En el Perú en 1998
COSTO - BENEFICIO
•Primero en el HNERM
IMPACTO DE LA AUTOMATIZACIÓN
• El impacto de la automatización de los hemocultivos versus la
metodología convencional puede ser evaluado desde 4 puntos de vista:
clínico, microbiológico, epidemiológico y económico.
IMPACTO CLÍNICO: La implementación de sistemas
automatizados de hemocultivos con monitoreo sensibles y continuos y
con agitación constante han llevado a un aumento de la velocidad de
detección, con una disminución del tiempo de respuesta y a un
aumento de la sensibilidad de los hemocultivos. Esto permite mejorar
la capacidad diagnóstica en bacteriemias y un uso más racional de la
terapia antimicrobiana.
IMPACTO MICROBIOLÓGICO: Ha sido principalmente una
disminución de la carga de trabajo con posibilidades de procesar
grandes volúmenes de muestras, una disminución de la contaminación
cruzada por técnicas de detección no invasivas y un aumento del
espectro de microorganismos que se detectan por estos sistemas.
IMPACTO EPIDEMIOLÓGICO: El soporte computacional que
poseen estos sistemas permiten obtener listados de positividad por
pacientes, por muestra, por microorganismo, conocer el rendimiento
(% de positividad) y la contaminación de los hemocultivos. Estos datos
se pueden evaluar por servicio, por tipo de muestra, diarios, semanales,
mensuales y/o anuales, lo que constituyen gran aporte en el control de
las bacteriemias intrahospitalarias.
• IMPACTO ECONÓMICO
A nivel del laboratorio: aumento del costo por botella (2 a 4 veces el costo de la convencional), disminución de las horas/hombre, disminución de los costos del material de resiembra, disminución del riesgo de cortopunzantes en el operador. Esto conduce a una disminución del costo global de los hemocultivos negativos siempre y cuando no se considere el costo del equipo.
A nivel del hospital: podría conducir a una disminución de los días de uso de antibióticos de amplio espectro (más caros y con mayor toxicidad) y podría significar también una disminución de los días/cama; sin embargo casi no existen publicaciones que avalen estos impactos.
Tres de tales sistemas: El BacT/Alert; el BACTEC
9240/9120 y el TREK tienen un uso muy extendido. El
sistema de cultivo de sangre BioMeriux Vital no esta
autorizado por la FDA (en USA) sin embargo tiene
ensayos exitosos.
Sistema Bact/alert
SISTEMA BacT/Alert (OrganonTeknika)
MECANISMO DE DETECCIÓN BacT/Alert
Sistema Bactec
Analizador
Sensor Señal fluorescente
Detector
BACTEC 9000 SYSTEMS
BACTEC 9000 SYSTEMS
• Permite una detección
más temprana y rápida
• Viales con resinas para
neutralización de
antibióticos
Lectura cada 10 minutos
Precocidad en el
diagnóstico del paciente
Aumenta rendimiento
BACTEC 9000 SYSTEMS Resinas
• Dos tipos de Resinas :
– Resinas de intercambio catiónico: Se unen
iónicamente a los antimicrobianos cargados
positivamente como los aminoglucósidos.
– Resinas absorbentes poliméricas (Hidrofóbicas):
Se unen a las porciones hidrofóbicas de
prácticamente cualquier antimicrobiano.
resinas
Sistema Trek
SISTEMA TREK
Antes Sistema ESP(Extra sensing Power)
• Este difiere de los 2 anteriores debido a :
1) La producción de CO2 es monitoreada por manometria.
2) Tanto la producción como el consumo de gas son monitoreados.
3) Cambios en la [ ] de H2 y O2 son detectados además del de
CO2 (Principal ventaja porque las lecturas se hacen 1 a 8
horas antes que aquellos sistemas que solo detectan CO2 –
Ayuda en organismos asacaroliticos que no produzcan suficiente
CO2)
• La unidad también actúa como auto contenido, agitador y detector.
• Presenta capacidad para 128 o 384 frascos.
Tinción de gram con resinas (BACTEC)
Tinción de gram con carbon (BACT/ALERT)
Diferencias BACTEC vs BACT/ALERT
Botellas de BACTEC
Botellas de VERSATREK
La botella tiene
una sola
etiqueta de
código de barra
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in
patients with suspected bloodstream infections.
Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
Comparison of the VersaTrek blood culture system against the Bactec 9240 system in patients with
suspected bloodstream infections.
Annal of clinical Microbiology and Antimicrobial 2011, 10;4
Brucella?
Haemophilus?
Diferencias BACTEC vs VERSATREK
Automatización
en tuberculosis
Bactec MGIT 960
fluorometrico
MGIT Bactec 460
radiometrico
COMPARACION
Bactec MGIT 960
fluorometrico
Tiempo hasta que el cultivo de positivo
-
0
50
100
0 10 20 30 40 50 60
Dias
% P
os
itiv
o
MODS
MBBacT
LJ
7 13 26 7 13 26
Moore DAJ et al, NEJM 2006; 355 (15): 1539 - 50
-
MODS - características diagnósticas
MODS MBBacT LJ
Sensibilidad - cultivo 98% 89% 84%
Especifidad - cultivo 99.6% 99.9% 100%
Características - PS (sens, espec, VPP & VPN)
Equivalente
Costo Diagnostico + PS (USD)
2 50 9
GRACIAS