Date post: | 10-Jul-2015 |
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Genética de Poblaciones Parentesco entre individuos
Cátedra de Genética y Mejoramiento Animal
1.- Importancia del conocimiento del parentesco entre individuos2.- Bases del parentesco3.- Parentesco directo4.- Parentesco colateral5.- Parentesco aditivo6.- Coeficiente de consanguinidad de un individuo7.- Calculo del coeficiente de parentesco aditivo y del coeficiente de consanguinidad.6.- Parentesco por dominancia
Usos del conocimiento del parentesco entre individuos
Estimar parámetros poblacionales
Estimar Valores de Cría
Realizar detección de portadores
Aplicar distintos sistemas de apareamiento: endogamia - exogamia
Parecido entre individuos
i
k
iii EGP ±=
kkk EGP ±=
Causas genéticas
Causas ambientales
Combinación de ambas
Parecido entre individuos
EGiGdGaP iiii ±±±=
Causas Genéticas
EGiGdGaP kkkk ±±±=
genes Interac. Interac. alélicasalélicas
Interac. No alélicas
¿ Porqué dos individuos pueden compartir los mismos genes ?
• por azar: portan genes idénticos en estado
• por ser parientes: portan genes idénticos por descendencia
A1 A2 A3 A4
A2 A3A1 A3
A3 A3 A2 A3
Genes idénticos por descendencia son aquellos que son copia de un gen ancestral común
A1 A2 A3 A4
A2 A3A1 A3
Genes idénticos por descendencia son aquellos que son copia de un gen ancestral común
A3 A5
A2 A3A3 A3
Genes idénticos o iguales en estado son aquellos que tienen igual estado alelomórfico y función
A3 A3
Dos individuos son parientes cuando comparten genes idénticos por descendencia
DIRECTOS
padre – hijo
abuelo – nieto
bisabuelo - bisnieto
COLATERALES
hermanos enteros
medio hermanos
primos hermanos
Definición:
la probabilidad de que dos individuos compartan genes
idénticos por descendencia, o la probabilidad de que
un gen tomado al azar en un locus particular en uno de
ellos sea idéntico por descendencia con un gen tomado
al azar para el mismo locus en el otro individuo o la
proporción de genes idénticos por descendencia entre
dos individuos emparentados X e Y .
TIPO DE PARIENTES aXY
padre – hijo ½
abuelo – nieto ¼
hermanos enteros ½
medio hermanos ¼
tío – sobrino ¼
dobles primos hermanos ¼
simples primos hermanos 1/8
primos segundos 1/32
antecesor – descendiente en n generaciones (1/2)n
x
b1b1HOMOCIGOTA IDÉNTICO
Consanguíneo
Fx = coeficiente de consanguinidad del individuo X
FX = ½ a entre los padres de X
x
b1b1
Definición:
la probabilidad de que ambos alelos para un determinado locus sean idénticos por descendencia.
la fracción o proporción de loci homocigota idénticos para un individuo
Fx = coeficiente de consanguinidad del individuo X
A B
C D X
FE
HOMOCIGOTA
IDÉNTICO
b1b2 b3b4
b1b4b1b3 b1b2
b1b1 b1b1
HOMOCIGOTA
ORDINARIO
RESUMEN
PARIENTES aXY
Fx de la progenie
padre – hijo ½¼
abuelo – nieto ¼1/8
hermanos enteros ½¼
medio hermanos ¼1/8
tío – sobrino ¼1/8
dobles primos hermanos ¼1/8
simples primos hermanos 1/81/16
primos segundos 1/321/64
antecesor – descendiente en n generaciones (1/2)n
El coeficiente de consanguinidad de una población (F) será el promedio de los coeficientes de consanguinidad de
todos los individuos de la población
AÑO NAC
Nº VACAS
F %
2011 707602 5.75
2010 1043951 5.68
2009 1390069 5.55
2008 1537411 5.46
2007 1520640 5.35
2006 1571749 5.26
2005 1559559 5.15
2004 1522189 5.05
2003 1433814 4.94
2002 1376218 4.83
2001 1322492 4.68
2000 1318383 4.55
1999 1239268 4.40
1998 1178752 4.27
1997 1147244 4.12
1996 1095238 3.94
1995 1129311 3.72
1994 1139597 3.50
1993 1133030 3.28
1992 1146562 3.04
1991 1157040 2.83
Tendencia del Coeficiente de Consanguinidad en vacas Holstein (Diciembre 2011)
http://aipl.arsusda.gov/eval/summary/inbrd.cfm
AÑO NAC
Nº VACAS F %
2011 60219 7.05
2010 97448 7.09
2009 127019 7.05
2008 130923 6.87
2007 125691 6.91
2006 118678 6.86
2005 114610 6.78
2004 108604 6.84
2003 96048 6.80
2002 93122 6.44
2001 87753 6.29
2000 86245 6.12
1999 80559 5.93
1998 75307 5.66
1997 70737 5.37
1996 66618 5.06
1995 65992 4.83
1994 66681 4.65
1993 66159 4.38
1992 68160 3.97
1991 70882 3.64
Tendencia del Coeficiente de Consanguinidad en vacas Jersey (Diciembre 2011)
http://aipl.arsusda.gov/eval/summary/inbrd.cfm
C
B
A
E D
ORDENADOS CRONOLOGICAMENTE DE LOS MÁS VIEJOS A LOS MÁS JÓVENES
SIEMPRE PRIMERO LOS MACHOS Y LUEGO LASHEMBRAS
C
B
E
A
D
Estimación del Parentesco Aditivo: Método Tabular
Individuo padre madre
A C B
D E B
C
B
E
A
D
Fórmulas de trabajo )Y madre- XY padre- XXY a(a2
1a +=
XXX F1a += X de padresX a 2
1F =
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B
C
E
A
D
• colocar la identificación de cada animal por orden de
nacimiento en encabezado de filas y columnas,
primero los machos y luego las hembras.
• En las columnas indicar quienes son los
progenitores para cada uno de los integrantes del
pedigree
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B 1+0 0 0 0.5 0.5
C
E
A
D
• completar las celdas comenzando por la primera
(que siempre corresponde a un individuo consigo mismo)
y continuar siempre de izquierda a derecha, hasta
completar la fila.
101F1a BBB =+=+= 0(0)2
1a
2
1a
2
1F ??B de padresB ====
00)(02
1)a(a
2
1a B?B?BC =+=+= 00)(0
2
1)a(a
2
1a B?B?BE =+=+=
0.50)(12
1)a(a
2
1a BCBBBA =+=+= 0.50)(1
2
1)a(a
2
1a BEBBBD =+=+=
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B 1+0 0 0 0.5 0.5
C 0
E 0
A 0.5
D 0.5
• Cuando se completa la primera fila se trasladan los
valores a la primera columna
101F1a BBB =+=+= 0(0)2
1a
2
1a
2
1F ??B de padresB ====
00)(02
1)a(a
2
1a B?B?BC =+=+= 00)(0
2
1)a(a
2
1a B?B?BE =+=+=
0.50)(12
1)a(a
2
1a BCBBBA =+=+= 0.50)(1
2
1)a(a
2
1a BEBBBD =+=+=
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B 1+0 0 0 0.5 0.5
C 0 1+0 0 0.5 0
E 0
A 0.5
D 0.5
• Se continúa el procedimiento de igual
forma para el resto de filas y columnas
101F1a CCC =+=+= 0(0)2
1a
2
1a
2
1F ??C de padresC ====
00)(02
1)a(a
2
1a C?C?CE =+=+= 0.51)(0
2
1)a(a
2
1a CCCBCA =+=+=
00)(02
1)a(a
2
1a CECBCD =+=+=
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B 1+ 0 0 0 0.5 0.5
C 0 1+ 0 0 0.5 0
E 0 0
A 0.5 0.5
D 0.5 0
• Se continúa el procedimiento de igual
forma para el resto de filas y columnas
101F1a CCC =+=+= 0(0)2
1a
2
1a
2
1F ??C de padresC ====
00)(02
1)a(a
2
1a C?C?CE =+=+= 0.51)(0
2
1)a(a
2
1a CCCBCA =+=+=
00)(02
1)a(a
2
1a CECBCD =+=+=
? -?B
? -?C
? -?E
B – CA
B – ED
B 1+ 0 0 0 0.5 0.5
C 0 1+ 0 0 0.5 0
E 0 0 1+ 0 0 0.5
A 0.5 0.5 0 1+ 0 0.25
D 0.5 0 0.5 0.25 1+ 0
Parentesco por Dominancia (dXY)
La relación por dominancia entre un par de individuos
emparentados, es definida como la probabilidad de que
compartan Genotipos Idénticos por descendencia.
dXY = (a XP YP * a XM YM + a XP YM * a XM YP)
4
dXY = (a XP YP * a XM YM + a XP YM * a XM YP)
4
A C
B D
?? ?? A - B A - B
A B C D
A 1 0 1/2 1/2
B 0 1 1/2 1/2
C 1/2 1/2 1 1/2
D 1/2 1/2 1/2 1
dCD = a AA * a BB + a AB * a BA) / 4
dCD = [(1)*(1) + (0)*(0)] / 4
dCD = 1/4
PARIENTES aXYFx de la progenie dXY
padre – hijo ½¼ 0
abuelo – nieto ¼1/8 0
hermanos enteros ½¼ ¼
medio hermanos ¼1/8 0
tío – sobrino ¼1/8 0
dobles primos hermanos ¼1/8 0
simples primos hermanos 1/81/16 0
primos segundos 1/321/64 0
antecesor – descendiente en n
generaciones(1/2)n