2500
BIOMOLECULAS
(REPRESENTADAS POR MODELOS
DE ESFERAS Y TUBOS) A TRAVES
DE UN CANAL CELULAR…
EL TAMAÑO DE LAS MOLECULAS ES FUNDAMENTAL EN ESTOS
PROCESOS Y, EN ESTE CASO, LOS MODELOS USADOS DEVALORAN
ESTE PARAMETRO
HUGO TORRENS
X X X
EL TAMAÑO DE LOS ATOMOS...
...PERO ¿CUALES?...
¿CON MAS O MENOS ELECTRONES?
¿EN COMPUESTOS IONICOS?
X X X
¿EN COMPUESTOS COVALENTES?
X
HUGO TORRENS
2502
X X X X
X X
X X
¿O NO METALICOS?
EL TAMAÑO DE LOS ATOMOS...
¿CÓMO ELEMENTOS ...METALICOS?
HUGO TORRENS
2504
RADIO IONICO
RADIO COVALENTE
Dionico= rionico A + rionico B
Dcoval AB = rcoval A + rcoval B
RADIO DE VAN DER WAALS
VDW VDW DVDW= rVDW A + rVDW B
HUGO TORRENS
2505
RADIO METALICO
RADIOS DE BRAGG-SLATER
AJUSTE PONDERADO
RADIOS TEORICOS
<r>
DISTANCIA ENTRE EL NUCLEO Y EL ELECTRON DE
VALENCIA
r(max)
MAXIMO DE LA FUNCION DE DISTRIBUCION RADIAL
HUGO TORRENS
2505A
PROPIEDADES PERIODICAS
RADIO ATOMICO EN PICOMETROS
RADIO ATOMICO pm
HUGO TORRENS
2505B
LiBe
B
C N O F
60
80
100
120
140
pm
H
LiNa
K
0
100
200
300
400
pm
RADIOS COVALENTES EN PERIODOS Y FAMILIAS
HUGO TORRENS
2506
H
LiNa
K
0
50
100
150
200
250
pm
LiBe
B
C N O F
60
80
100
120
140p
m
...Y EN EL PERIODO 2.
RADIOS COVALENTES EN LA FAMILIA 1...
HUGO TORRENS
2507
PROPIEDADES PERIODICAS
RADIO DE VAN DER WAALS pm
RADIO DE VAN DER WAALS pm
HUGO TORRENS
2510
RADIO DE VAN DER WAALS PARA
DISTINTOS ELEMENTOS (pm)
H
K
Kr
In
U
Tl Pb
Hg
Pt
Au
XeTe
I
Sn
Ag
Cd
SeBrGa
CuZn
Ni
Ar
Cl
P
S
Si
MgC
F
Ne
N
O
He Li
Na
Pd
110
130
150
170
190
210
230
250
270
290
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
No. ATOMICO
RA
DIO
DE
VD
W (p
m)
2516
H
He LiC
N O FNe
Na
Mg
100
120
140
160
180
200
220
240
pm
RADIOS DE VAN DER WAALS
LOS RADIOS DE VDW TIENDEN A CRECER EN UNA
FAMILIA Y A DISMINUIR EN UN PERIODO
...NOTE EL VALOR DEL HELIO
HUGO TORRENS
2518
RADIO ATOMICO pm
RADIO COVALENTE pm RADIO DE VAN DER WAALS pm
RADIO IONICO pm
2300E
HUGO TORRENS
Rn
Xe
Kr
Ar
Ne
He
At
I
Po
Sb
Bi
Sb
Br
Cl
F
Se
S
O
As
P
N
Pb
Sn
Ge
Ra Fr
Tl
In
Ga
Hg
Cd
Zn
Au
Ag
Cu
Pt
Pd
Ni
Ir
Rh
Co
Os
Ru
Fe
Re
Tc
Mn
W
Mo
Cr
Ta
Nb
V
Hf
Zr
Ti
Lu
Y
Sc
Ba
Sr
Ca
Cs
Rb
K
Mg
Be
Na
Li
H
Si Al
C B
18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1
HUGO TORRENS
Radios RADIO ATOMICO pm
Rn
Xe
Kr
Ar
Ne
He
At
I
Po
Sb
Bi
Sb
Br
Cl
F
Se
S
O
As
P
N
Pb
Sn
Ge
Ra Fr
Tl
In
Ga
Hg
Cd
Zn
Au
Ag
Cu
Pt
Pd
Ni
Ir
Rh
Co
Os
Ru
Fe
Re
Tc
Mn
W
Mo
Cr
Ta
Nb
V
Hf
Zr
Ti
Lu
Y
Sc
Ba
Sr
Ca
Cs
Rb
K
Mg
Be
Na
Li
H
Si Al
C B
18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1
HUGO TORRENS
Radios RADIO IONICO pm
Rn
Xe
Kr
Ar
Ne
He
At
I
Po
Sb
Bi
Sb
Br
Cl
F
Se
S
O
As
P
N
Pb
Sn
Ge
Ra Fr
Tl
In
Ga
Hg
Cd
Zn
Au
Ag
Cu
Pt
Pd
Ni
Ir
Rh
Co
Os
Ru
Fe
Re
Tc
Mn
W
Mo
Cr
Ta
Nb
V
Hf
Zr
Ti
Lu
Y
Sc
Ba
Sr
Ca
Cs
Rb
K
Mg
Be
Na
Li
H
Si Al
C B
18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1
HUGO TORRENS
Radios RADIO COVALENTE pm
Rn
Xe
Kr
Ar
Ne
He
At
I
Po
Sb
Bi
Sb
Br
Cl
F
Se
S
O
As
P
N
Pb
Sn
Ge
Ra Fr
Tl
In
Ga
Hg
Cd
Zn
Au
Ag
Cu
Pt
Pd
Ni
Ir
Rh
Co
Os
Ru
Fe
Re
Tc
Mn
W
Mo
Cr
Ta
Nb
V
Hf
Zr
Ti
Lu
Y
Sc
Ba
Sr
Ca
Cs
Rb
K
Mg
Be
Na
Li
H
Si Al
C B
18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1
HUGO TORRENS
Radios RADIO DE VAN DER WAALS pm
3400
HUGO TORRENS
DISTANCIA DE ENLACE
LONGITUD DE ENLACE
TOPOLOGIA MOLECULAR
ANGULO DE ENLACE
ESQUEMA DEL SITIO ACTIVO DE LA ENZIMA PNP QUE, GRACIAS A SU
CONFORMACION, UNE AL ION FOSFATO (ROSA) Y AL NUCLEOSIDO
PURINICO, QUE ESTA FORMADO POR UNA BASE NITROGENADA
(AZUL) UNIDA A UN AZUCAR (CAFÉ).
3404
PURINA
NUCLEOSIDO
PURINICO
AZUCAR
FOSFATO SITIO
ACTIVO DE
LA PNP
HUGO TORRENS
3405
ESTA CERCANIA FACILITA EL ROMPIMIENTO DEL NUCLEOSIDO. PARA
EVITAR ESTE EFECTO, SE DISEÑAN FARMACOS CON LA FORMA
ESPECIFICA PARA QUE LO IMPIDAN…
HUGO TORRENS
3406
DISTANCIA DE ENLACE.
SEPARACION ENTRE DOS NUCLEOS UNIDOS
POR UN ENLACE QUIMICO.
H
H
O
EN AGUA MOLECULA:
PERO TAMBIEN…
H
H
O
H
H
O
H
H
O
H
H
O
H
H
O
H
H
O
H
H
O
DISTANCIA DE ENLACE
COVALENTE
HUGO TORRENS
3409
HUGO TORRENS
Li+
73 pm
NC 4
Li+
90 pm
NC 6
Li+
106 pm
NC 8
Li
167 pm
F
42 pm
F-
119 pm
NC 6
F-
117 pm
NC 4
CAMBIO DE TAMAÑO
DE ELEMENTO NEUTRO
(RADIO ATOMICO CALCULADO)
A ION
(RADIO IONICO POR NC)
PRIMERA IMPRESION DE RAYOS-X.
DICIEMBRE 22, 1895.
3402
HUGO TORRENS
3432
HUGO TORRENS
LAMPARA
DE RAYOS X
COLIMADOR
CRISTAL
PLACA FOTOGRAFICA
RAYO INCIDENTE
RAYO DIFRACTADO
10 000-
40 000 VOLTS
3434
HUGO TORRENS
3438
HUGO TORRENS
PATRONES DE DIFRACCION DE RAYOS-X
3436
HUGO TORRENS
3408
DISTANCIA DE ENLACE
SEPARACION ENTRE DOS NUCLEOS UNIDOS POR UN
ENLACE QUIMICO.
F
F
F F S
F
F SEIS
DISTANCIAS
IGUALES
LA DISTANCIA S F ES: 169 pm
1.69Å
169x10-12m
ES UNA DISTANCIA EQUIVALENTE A TENER EL NUCLEO DE AZUFRE
AQUI Y EL NUCLEO DE FLUOR EN… ¡ RECTORIA !
CONSIDERE LA MOLECULA DE
HEXAFLUORURO DE AZUFRE
HUGO TORRENS
3410
DISTANCIA DE ENLACE
SEPARACION ENTRE DOS NUCLEOS UNIDOS POR
UN ENLACE QUIMICO.
DISTANCIAS DE ENLACE EXPERIMENTALES:
C-C N-N O-O
120 110 106
134 124 121
154 147 148
120 CC 110 NN 106 OO
14 14 15
134 C=C 124 N=N 121 O=O
20 23 27
154 C-C 147 N-N 148 O-O
HUGO TORRENS
3412 DISTANCIA DE ENLACE
SEPARACION ENTRE DOS NUCLEOS UNIDOS
POR UN ENLACE QUIMICO.
DISTANCIAS DE ENLACE EXPERIMENTAL
C-C
CC
DISTANCIAS
DE ENLACE
ORDEN DE ENLACE
C=C
110
115
120
125
130
135
140
145
150
155
C-C C=C C=C
C=C
HUGO TORRENS
3414
DISTANCIA DE ENLACE
RADIOS IONICOS
50
70
90
110
130
150
170
190
Be
Li
Mg
Na
Ca
K
Sr
Rb
Ba
Cs
ELEMENTOS
pm
RADIOS IONICOS
50
70
90
110
130
150
170
190
Be
Li
Mg
Na
Ca
K
Sr
Rb
Ba
Cs
ELEMENTOS
pm RELACIONES DIAGONALES
HUGO TORRENS
3416 DISTANCIA DE ENLACE
SEPARACION ENTRE DOS NUCLEOS UNIDOS POR UN ENLACE QUIMICO.
CONSIDERE LA MOLECULA DE DIFLUORURO DE AZUFRE
F
F S
DOS
DISTANCIAS
IGUALES.
SEGUN TABLAS LA DISTANCIA S----F ES:
RADIO COVALENTE DEL S
MAS RADIO COVALENTE DEL F
(102pm) + (71pm) = 173pm
EXPERIMENTALMENTE LA DISTANCIA ES 174pm
HUGO TORRENS
3416A
HUGO TORRENS
ALGUNOS MODELOS SON ENGAÑOSOS RESPECTO AL TAMAÑO…
…PORQUE SOLO UBICAN A LOS NUCLEOS
CF4
3416A
HUGO TORRENS
ALGUNOS MODELOS SON ENGAÑOSOS RESPECTO AL TAMAÑO…
…PORQUE SOLO UBICAN A LOS NUCLEOS
CF4
3416B
HUGO TORRENS
rvdw
rcov + rcov
rvdw + rvdw
BF3 2(147) pm
82 pm
71 pm
3416C
HUGO TORRENS
O O H H
F F
rvdw + rcov + rcov + rvdw
rvdw + rvdw
rvdw + rcov + rcov + rvdw
rvdw + rcov + rcov + rvdw
rvdw + rvdw
rvdw + rvdw
3416D
HUGO TORRENS
DISTANCIAS CARBONO-CARBONO
C C
C C
C C
120 pm
134 pm
154 pm
CH3-CH3
3416E
HUGO TORRENS
DIAMETROS Y RADIOS DE VAN DER WALLS
He
Ne
He
Ne
140 pm
154 pm
3418 DISTANCIA DE ENLACE
?
ORDEN 4
120pm CC
130pm C=C
150pm C-C
ORDEN CERO??
HUGO TORRENS
3420 EN 1997 (JACS, 1997, 5471) G.H. ROBINSON PUBLICA LA PREPARACION
DE DOS COMPUESTOS PARA LOS QUE POSTULA UN TRIPLE ENLACE
GaGa, DESCONOCIDO HASTA ENTONCES, TAMPOCO SE CONOCE
NINGUNA MOLECULA CON Ga=Ga...
GALIO
SODIO
CARBON
GALIO
HIERRO
CARBON
OXIGENO
MARZO 1998… HUGO TORRENS
3422
DISTANCIA Fe-Ga 222.48 pm LA MAS CORTA CONOCIDA…
Fe-Ga-C PERFECTAMENTE LINEAL (180º)
F. ALBERT COTTON:
"…ES TAN TRIPLE ENLACE COMO YO SOY EL DALAI LAMA."
ES COMPARABLE A LA DISTANCIA Fe-P EN (C6H5)3PFe(CO)4 A
LA QUE NADIE SE LE OCURRE LLAMAR TRIPLE ENLACE…
HUGO TORRENS
3423
PARA EL COMPUESTO GaGa , CON 231.9 pm, LA
MAS CORTA CONOCIDA, LA SITACION ES MAS
COMPLEJA:
EL FRAGMENTO C-Ga-Ga-C NO ES LINEAL
TEORICAMENTE NO SE JUSTIFICA CALIFICAR LA UNION
Ga-Ga COMO ENLACE TRIPLE Y SON LOS ATOMOS DE
SODIO LOS QUE COMPACTAN AL COMPUESTO…
HUGO TORRENS
3425
PRIMERA
EVIDENCIA DE
1999!!!
C Si
HUGO TORRENS
3427
PRIMER
Bi=Bi
Bi=Bi 6%
MAS CORTO
QUE Bi-Bi
Bi=Bi-C 100.5o
EN VEZ DE
109o
HUGO TORRENS
Akira Sekiguchi, Rika Izumi, Vladimir Ya. Lee,
Masaaki Ichinohe
J. AM. CHEM. SOC. 2002, 124, 14822-14823
3430
HUGO TORRENS
PRIMER ENLACE DOBLE SILICIO=ESTAÑO
241.88(14)pm