Organización celular procarionte y eucarionte
En eucariontes la transcripción se encuentra espacial y temporalmente separada de la traducción
mRNA
rRNA
tRNA
snRNA
snoRNA
scaRNA
miRNA
siRNA
Otros no codificantes
ü RNA mensajero, codifica para proteína
ü RNA ribosomal, componente estructural del ribosoma
ü RNA de transferencia, adaptador entre mRNA y proteína
ü RNAs pequeños nucleares, funcionan en corte y empalme de intrones
ü RNAs pequeños nucleolares, procesamiento y modificación de rRNA
ü RNAs pequeños de cajal, modifican snoRNAs, snRNAs, miRNAs, regulan traducción específica
ü microRNAs, regulan la expresión genética
ü RNAs pequeños interferentes, apagan la expresión de genes mediante degradación de mRNAs específicos y mediante modificación epigenética del DNA
ü Otros RNAs no codificantes que funcionan en procesos diversos como síntesis de telómeros, inactivación del cromosoma X, transporte de proteínas, etc.
DNA RNA Transcripción
Eucariontes
Dúplex Región de cadena sencilla
Tallo - asa Protuberancia
Burbujas internas
Desapareamiento, simétrica, asimétrica
Juntas
Tres tallos, cuatro tallos
El RNA es mono-catenario pero puede formar regiones de doble cadena
Los ribonucleótidos pueden presentar diversas modificaciones necesarias para cumplir su función
Estas modificaciones son comunes en el tRNA
Transcripción
RNA polimerasa
Solo se utiliza una de las cadenas como molde
molde
codificante
El RNA transcrito es complementario a la secuencia de la cadena de DNA que se utilizó como molde y es idéntico a la cadena CODIFICANTE excepto por la presencia de U.
Caja Pribnow: TATAAT
Secuencia – 35: TTGACA
Elemento UP: AAAWWTWTTTTNNNAAANNN
W: A/G N: cualquier nucleótido
(opcional)
INICIO (Bacteria)
Promotor: secuencias que reconoce la RNA polimerasa y proteínas asociadas a ella para iniciar la transcripción
La dirección de la transcripción de los genes puede variar en el cromosoma
Operón: Varios genes regulados por un solo promotor
Subunidades de la RNA polimerasa bacteriana
Centro catalítico
Especificidad promotor
- no requiere cebador - utiliza Mg2+ como cofactor - utiliza NTPs como sustrato - transcribe en sentido 5’ → 3’
Existen diferentes estados en la Iniciación de la Transcripción
Factor sigma
Complejo cerrado
Complejo abierto (12 nt)
Escape del promotor
Síntesis de 10 nt de RNA
Liberación de Sigma
Elongación de la transcripción
La polimerasa mantiene unos 10-12 nt desapareados en el DNA: lugar donde ocurre la síntesis de RNA
Elongación de la transcripción
Múltiples moléculas de RNA polimerasa se encuentran transcribiendo el Operón; así de una molécula de DNA codificante la célula fabrica la cantidad de moléculas de RNA que requiere para su función.
Terminación de la transcripción bacteriana
terminadores intrínsecos, independientes de la proteína ρ (Rho); se forman en el RNA transcrito por apareamiento, pausan a la Polimerasa y esta libera el RNA recién sintetizado
Terminadores dependientes de Rho; La proteína Rho (helicasa) se une al RNA en regiones ricas en C (sitios rut) y avanza hasta la burbuja de transcripción donde desenrolla el complejo DNA:RNA y libera el transcrito
sitios RUT: regiones ricas en C
Las rifampicinas son antibióticos producidos por Streptomyces mediterranei, con buena actividad contra bacterias Gram-positivas y contra Mycobacterium tuberculosis. Su mecanismo de acción estriba en la inhibición del inicio de la transcripción, uniéndose de modo no covalente a la subunidad ß de la RNA polimerasa bacteriana.
Inhibidor de la transcripción en bacteria: Rifampicina B