Tema 5. Diagnóstico microbiológico
1. Definición y propósito del diagnóstico microbiológico2. Ciclo del diagnóstico microbiológico3. Etapas del diagnóstico microbiológico
3.1. Fase pre-analítica3.1.1. Solicitud de análisis3.1.2. Toma de la muestra3.1.3. Transporte de la muestra al laboratorio3.1.4. Recepción y registro de la muestra en el laboratorio
3.2. Fase analítica3.2.1. Métodos no basados en el cultivo de la muestra3.2.2. Cultivo de la muestra3.2.3. Identificación del agente etiológico3.2.4. Determinación de la sensibilidad a antimicrobianos
3.3. Fase post-analítica3.3.1. Elaboración de un informe de resultados de laboratorio3.3.2. Control de calidad de los resultados de laboratorio
4. Responsabilidad del microbiólogo clínico5. Relación entre el microbiólogo y el clínico.
Definición
1. Definición y propósito del diagnóstico microbiológico
Propósito
• Tratamiento
• Colaboración estrecha entre el médico y el microbiólogo
• Rapidez de los resultados
• Evitar la propagación de epidemias
• Enfermedades de declaración obligatoria
2. Ciclo del diagnóstico microbiológico
PACIENTE CONSULTA AL
MÉDICO
MÉDICO ESTABLECEDIAGNÓSTICO
CLÍNICO PRESUNTIVO
SE TOMA MUESTRADEL PACIENTE
EXAMEN DIRECTODE LA MUESTRA
INFORME PRESUNTIVODEL LABORATORIO
PROCESAMIENTODE LA MUESTRA
IDENTIFICACIÓNPRUEBAS
ANTIMICROBIANAS
SE ENVÍA AL MÉDICOEL INFORME FINAL
MÉDICO ESTABLECE LA TERAPIA APROPIADA
SE TRANSPORTA LAMUESTRA AL LABORATORIO
Fase pre-analíticaFase analíticaFase post-analítica
3.1.2. Toma de la muestra
Las muestras pueden ser tomadas por paciente, ATS o médico.
Es fundamental que cumplan los requerimientos adecuados (esterilidad, recipiente adecuado, volumen, mínima contaminación con microbiota normal, etc.).
3.1.3. Transporte de la muestra al laboratorio
La demora debe ser mínima.
Se debe mantener la viabilidad de los microorganismos durante el transporte (medios de transporte, refrigeración, anaerobiosis, etc.).
3.1.4. Recepción y registro de la muestra en el laboratorio
Rechazo de las muestras.
Diagnóstico clínico (pruebas diagnósticas previas)
Observación macroscópica
Observación microscópica (observación en fresco y tinciones)
3.2. Fase analítica
3.2.1. Métodos no basados en el cultivo de la muestra
Pruebas químicas
Pruebas genéticas e inmunológicas en muestras crudas
3.2.1. Métodos no basados en el cultivo de la muestra
Etapa limitante del diagnóstico microbiológico
Selección de los medios de cultivo
Aislamiento del microorganismo causante de la infección en cultivo puro
3.2.2. Cultivo de la muestra
Identificación
Pruebas bioquímicas (actividades bioquímicas y
crecimiento en fuentes de carbono)
Pruebas genéticas e inmunológicas (en cultivo puro)
Nivel de identificación requerido
Especies patógenas y no patógenas
Especies indicativas de enfermedades
Identificación de cepas
Recidivas
Estándar de calidad
Cuantificación de los resultados
3.2.3. Identificación del agente etiológico
Pruebas para determinar la CMI
Antibiograma
3.2.4. Determinación de la sensibilidad a antimicrobianos
3.3. Fase post-analítica
3.3.1. Elaboración de un informe de resultados de laboratorio
3.3.2. Control de calidad de los resultados de laboratorio
• Rapidez de los resultados
– Morbilidad y mortalidad
– Observación de los cultivos
– Pruebas rápidas
– Servicio permanente del laboratorio de microbiología clínica
• Responsabilidad frente al médico
• Responsabilidad frente al paciente
• Responsabilidad frente a las autoridades sanitarias
4. Responsabilidad del microbiólogo clínico
• Conveniencia de buen entendimiento
• Consejos del microbiólogo al médico
– Muestras más adecuadas
– Toma de muestras
– Transporte
– Presencia de microbiota normal en la muestra
– Posibilidad de que esos microorganismos pueden llegar a ser patógenos
• Informes precisos
5. Relación entre el microbiólogo y el clínico