Catlogos de Autoridades Taxonmicas
(CAT)
Bitica 5.0
Subcoordinacin de Catlogos de
Autoridades Taxonmicas [email protected]
Qu son los Catlogos de Autoridades
Taxonmicas?
Bases de datos que renen los nombres cientficos de las especies de diferentes grupos taxonmicos con distribucin
natural en Mxico
Arreglo taxonmico basado en sistemas de clasificacin reconocidos (jerrquico desde reino hasta especies e
infraespecies)
Nomenclatura basada en los cdigos de nomenclatura vigentes
Diferentes niveles de completitud dependiendo del contenido y disponibilidad de la informacin
Bases de datos que pueden usarse como estndares Basados en consideraciones importantes de taxonoma
y nomenclatura
Por qu usar estndares?
Estndares: modelos o patrones usados como referencia para
objetivos particulares
Requisitos mnimos que garantizan informacin homognea y de calidad
Reglas internacionalmente aceptadas
Referidos por un elevado nmero de personas
Ejemplos:
Cdigos internacionales de Nomenclatura
Autores de plantas. Brummitt & Powell, 1992
Botanico Periodicum Huntianum
Los CAT estn basados en dos grandes estndares:
nomenclatura biolgica
taxonoma
Taxonoma
: arreglar, poner en orden
Taxonoma: de Candolle, 1813
Taxon, taxa: Meyer, 1926
Taxonoma: Disciplina cientfica (parte de la sistemtica) que
propone una clasificacin cientfica
de los organismos vivos en
unidades biolgicas particulares
llamados taxones o taxa (Dubois,
2012)
Nomenclatura
: nombre, sustantivo, palabra, trmino Nomenclatura: Disciplina de la taxonoma que incluye
la teora y reglas para nombrar a los taxones o taxa
Resulta en la aplicacin de las reglas nomenclaturales de la taxonoma de un grupo de organismos (Dubois, 2012)
Reino: Plantae
Divisin: Magnoliphyta (phyta)
Clase: Dicotyledonae (opsida)
Subclase: --- (idae)
Orden: Rosales (ales)
Suborden: --- (inales)
Familia: Rosaceae (aceae)
Subfamilia: --- (oideae)
Tribu: --- (eae)
Subtribu: --- (ineae)
Gnero: Prunus
Subgnero: ---
Seccin: ---
Subseccin: ---
Serie: --
Subserie: ---
Especie: Prunus serotina Ehrh.
Subespecie: P. serotina subesp. capuli (Cav.) McVaugh
Variedad: ---
Subvariedad: ---
Forma: ---
Subforma: ---
Rangos de los taxones
Con base en el Cdigo
Internacional de
Nomenclatura Botnica
Slo en grupos grandes y complejos llegan a utilizarse
el total de las categoras
Esta forma de establecer categoras da orden y
accesibilidad a la
clasificacin de los
organismos y proporciona un
importante sistema de
entrada y recuperacin de
informacin
Importancia de los CAT
Bases de datos sistematizadas para un grupo taxonmico
Permiten conocer el estatus taxonmico actual de cada uno de los taxones que conforman dichos grupos, as como las
relaciones de sinonimia
Facilitan la captura de informacin taxonmica
Sirven de control de la calidad de los datos
Facilitan la consulta e intercambio de la informacin taxonmica con otras bases sistemticas(GSDs)
Vincular y armonizar los catlogos
taxonmicos de
programas mundiales
de biodiversidad con el
Catalogue of Life
(CoL) para crear una
comunidad
taxonmica virtual.
Imgenes de satlite
Cartografa electrnica de numerosos temas
Monitoreo de ecosistemas
Deteccin temprana de incendios
Herramientas estadsticas, analticas y para extrapolacin, desarrollos bioinformticos
Sntesis
Anlisis
Evaluaciones
Caractersticas:
Se actualiza constantemente Fuente pblica de informacin Accesible va www para diferentes usuarios
Fuentes de informacin:
Apoyo a proyectos Repatriacin de datos Literatura cientfica Minera de datos Colaboracin con expertos
Procesos de control
de calidad
Nomenclatura (CAT)
Bases de datos de ejemplares y de observaciones
Informacin ecolgica de las especies y sus principales factores de amenaza
Datos sobre el uso de las especies
Redes de expertos nacionales e internacionales
SNIB
Sistema Nacional de Informacin
sobre Biodiversidad
Listados
comentados*
Listado taxonmico*
(especies vlidas y sinnimos)
Listado nomenclatural*
(Checklists)
(especies vlidas)
Niveles de CAT (de acuerdo al contenido)
*Modificados de
GBIF, 2011
Proyectos
Control de calidad
(SIB)
Desarrollo /
actualizacin
de CAT en DTAP
Revisin por
taxnomos
expertos
Catlogo completo y finalizado
Asesoras para
actualizacin de CAT
CD de Bitica Pgina CONABIO
Publicaciones
(poltica
editorial)
Lineamientos CAT Criterios de calidad
(DTAP, SIB)
Desarrollo de Bds
(especialista / DTAP)
Memos de revisin
y correccin
Validacin de
especies
Metadatos
Lineamientos
CAT
Mtodo
Lineamientos
CAT Lineamientos
CAT
Los CAT en Bitica
Categoras taxonmicas:
obligatorias intermedias
Mdulo nomenclatural
Relaciones entre nombres
Es importante asociar la bibliografa
que respalda la relacin
Distribucin
asociado al
vlido
Definir el nivel
Nombre comn
asociado
al vlido
Definir la regin
Ambiente (u otras
caractersticas)
asociado al
vlido
Lista taxonmica
en formato PDF.
Contiene la
totalidad de
nombres en una
lista alfabtica con
los nombres
actualmente en
uso y sus
sinnimos
Escritura de los nombres regulada por cdigos de nomenclatura (ICBN y ICZN)
Taxones deben estar referidos a un autor y un ao de descripcin, as como a un sistema de clasificacin, arreglo taxonmico o referencia
Consistencia en la escritura de la informacin:
Autor, ao. Autores concatenados con & en lugar de and, y o et
Sinnimos, SIEMPRE relacionados a un nombre vlido
No se permiten relaciones entre nombres con el mismo estatus
Cita nomenclatural debe corresponder con el ao de descripcin del taxn
Uniformidad del contenido y en la estructura general de la base de datos.
Tipos de errores: omisin, redundancia, contenido, contexto
Criterios de revisin de la informacin
Cmo solicito un CAT en Bitica?
Utilidad de un CAT?
Solicitar al correo [email protected] el catlogo del
grupo de inters
Formatos de entrega: Bitica, checklist (pdf) y tabla plana (excel)
Taxonoma ya ingresada en el sistema
Revisar utilidad en el documento de metadatos de cada CAT
Posibilidad de unir en una sola BDs la taxonoma de grupos biolgicos muy distintos (plantas e insectos)
Metadatos CAT
Documento que informa el contenido general del catlogo:
Nmero de gneros, especies e infraespecies (vlidos y sinnimos)
Informacin adicional incluida
Sistemas de clasificacin y
catlogos de referencia
Calidad de los datos
Mtodo y actualizaciones
Informacin tcnica de Bitica
(registros por categora taxonmica)
Referencias bibliogrficas
Proyecto Titulo CAT
KT001 Catlogo de autoridades taxonmicas de platyhelmithes y acanthocephala parsitos de vertebrados silvestres de Mxico
Vertebrados (para asociar con los helmintos)
KT003 Protistas ciliados y flagelados hetertrofos
Ciliados (elaboracin) KT004 Catlogo de Autoridades Taxonmicas de las especies de
poliquetos (Annelida: Polychaeta) del Pacfico Mexicano y otras localidades del Pacfico Oriental Tropical Poliquetos (elaboracin)
KT006 Catlogo de especies de fitoplancton marino del Pacfico mexicano Fitoplancton (actualizacin)
JE011 Flora vascular y endemismos de las partes altas de varios macizos montaosos de Quertaro y norte de Michoacn-1ra Fase
Plantas (facilitar captura)
JF212 Anfibios y reptiles de las regiones Chimalapas (7) y bosque de conferas y BMM de Veracruz (11)
Anfibios y reptiles (facilitar captura)
Diferentes usuarios, diferentes
necesidades
CAT Grupos incluidos Especies
vlidas
Algas y
Protozoarios
Cianobacterias, Diatomeas, Macroalgas,
Protozoarios
4,465
Hongos Micromicetos y macromicetos 2,252
Plantas Briofitas, Pteridofitas, Gimnospermas,
Angiospermas
25,853
Invertebrados
Esponjas, placozoos, cnidarios, platelmintos,
rotferos, nematodos, acantocfalos,
anlidos, onicforos, tardgrados,
artrpodos, moluscos, fornidos,
equinodermos, quetognatos
44,064
Vertebrados Peces, anfibios, reptiles, aves, mamferos 5,594
En la descripcin de cada CAT se presenta el dato
de cobertura taxonmica de cada grupo
Catlogos por grupos taxonmicos (contenido 2013)
Contenido CAT de vertebrados
CAT Informacin adicional adems de la lista de nombres
correctos
Especies
vlidas
Peces Incluye sinonimia y nombres comunes
Actualizacin y revisin por pares pendiente.
Fuentes: Nelson, 2006.; Espinosa et al., 2008
2718
Anfibios Incluye sinonimia, citas, nombres comunes.
Revisin por pares pendiente.
Fuentes: Frost, 2011
380
Reptiles Sinonimia
Fuentes: Flores-Villela, 1993; Flores y Canseco, 2004; Reptile
Data Base, 2011, entre otros.
888
Aves Incluye sinonimia, nombres comunes y regin
Fuentes: American Ornithologist Union, 2012, Clements,
2011
1073
Mamferos Sinonimia, Regin. Diferente grado de avance en distintas
familias.
Fuentes: Ceballos et al., 2002; Ceballos y Oliva, 2005:
Ramrez-Pulido et al., 2005; entre otros.
532
CAT Informacin adicional adems de la lista de nombres
correctos
Especies
vlidas
Briofitas sinonimia y distribucin. Se requiere actualizar la
informacin.
Fuentes: Sharp, Crum & Eckel, 1994; Delgadillo, 2003
1,242
Pteridofitas sinonimia y distribucin. Informacin ms o menos
actualizada y completa.
Fuentes: Mickel & Smith, 2004; Smith, Pryer, Shuettpelz,
Korrall, Shneider & Wolf, 2006
1,101
Gimnospermas sinonimia y distribucin. Informacin ms o menos
actualizada y completa.
Fuentes: Farjon, A., J. Prez de la Rosa y B.T. Styles. 1997;
Farjon, A., 2001
162
Angiospermas sinonimia, distribucin y nombres comunes. La informacin
es muy completa para algunas familias y muy incompleta en
otras familias.
Fuentes: Cronquist, 1981; Dahlgren, Clifford & Yeo, 1985 y
referencias particulares por familia
23,069
Contenido CAT de plantas
Retos en la construccin de
los CAT
Relacin inversa entre el nmero de especies y los taxnomos expertos (impedimento taxonmico)
Tiempo extenso para su elaboracin
Informacin escasa / dispersa
Cambios contnuos en la taxonoma
Necesidad de validar las especies reportadas con ejemplares (visita a diferentes colecciones)
Cotejar y sintetizar diferentes puntos de vista en relacin con la clasificacin y la taxonoma
Decisiones colegiadas entre especialistas
GRACIAS!!!